Медицински университет – гр. Варна е основан през 1960 година като Висш медицински институт.
За рожденна дата е приета датата 1.10.1961 година. Датата е първият учебен ден на първата учебна година за първото Висше учебно заведение по медицина в Североизточна България.
Институтът е третото Висше медицинско заведение в страната.
През първите 10 години на функциониране на Института се развиват всички катедри и основни клиники.
Особено внимание се обръща на непрекъснатото подобряване на практическото обучение.
Разрастването на Висшето учебно заведение налага строителството на нови болнични сгради. Построени са Акушеро-гинекологична болница, Психиатрична болница (най-голямата на Балканския полустров), Очна болница, Терапевтична болница (настоящата университетска болница УМБАЛ „Света Марина“ ЕАД – Варна).
ВМИ– Варна, израства като крупен център за подготовка на лекарски кадри, за научни изследвания и внедрявания, за лечебно-диагностична, консултативна и организационно-методична помощ. Материално-техническата база на Института разполага с ценна и модерна апаратура.
През 1995 година, ВМИ - Варна е преименуван в Медицински университет – Варна.
През 2002 година Университетът приема за свое име името на Проф. д-р Параскев Стоянов.
МУ – Варна е утвърдена институция в областта на образованието и науката. От 2006 година лекарите-абсолвенти получават европейско приложение към своите дипломи, което е валидно за тяхната реализация в страните – членки на ЕС.