Защитени видове на територията на ТП Държавно горско стопанство Петрич са - дива котка от сем. Котки, златка от сем. Порови.
В района на горското стопанство се срещат и множество представители от разредите дневни грабливи, сови, пойни, синявицови, кълвачови, дългокраки и други защитени видове.
В ТП Държавно горско стопанство Петрич са обособени следните защитени зони по Натура 2000 - защитена зона птици Рупите с обща площ 98,2 хектара и защитена зона за опазване на природните местообитания и на дивата флора и фауна Беласица с площ 255.6 хектара.